Planctomycetes

? Planctomycetes
Научная классификация
Царство: Бактерии Тип: Planctomycetes Класс: Planctomycetia Порядок: Planctomycetales Семейство: Planctomycetaceae
Латинское название
Planctomycetes Schlesner et Stackebrandt, 1987
Роды
Gemmata Isosphera Pirellula Planctomyces candidatus Brocadia candidatus Kuenenia candidatus Scalindua candidatus Anammoxoglobus
Систематика на Викивидах Поиск изображений на Викискладе NCBI 203682

Planctomycetes — тип домена Бактерии, представители типа обитают в пресных и солёных водах^[1][2], являются важными членами почвенных микробных сообществ^[3], детектируются в торфяных сфагновых болотах^[4], обитают также в анаэробных источниках, богатых соединениями серы^[5]. Имеют уникальное для бактерий строение цитоплазмы и клеточной стенки, размножаются почкованием и имеют стебелёк, предназначенный для заякоривания на субстрате. Изучение представителей отдела представляет интерес для изучения эволюции и экологии микроорганизмов^[6].

Строение

Уникальной особенностью представителей типа Planctomycetes является отсутствие пептидогликана в клеточной стенке, вместо которого присутствует гликопротеин, содержащий много остатков глутаминовой кислоты. В мембране обнаружены гопаноиды — вещества, подобные стероидам, укрепляющие плазматическую мембрану и прежде обнаруженные лишь у аэробных микроорганизмов^[7]. Второй уникальной особенностью отдела является наличие компартментов в цитоплазме, ограниченных мембраной^[8] и ограничение нуклеоида двойной мебраной — особенность, характерная для эукариот и нехарактерная для прокариот^[9]. Компартмент, содержащий рибосомы и белки называется пиреоплазма или рибоплазма, безрибосомный компартмент называется парифоплазма^[10].

Геном

Сравненительный анализ нуклеотидных последовательностей 16S рРНК показывает, что отдел имеет высокий уровень гомологии с тремя другими отделами — Verrucomicrobia, Chlamydiae и Lentisphaerae, образуя надотдел^[11]. Изучение геномов представителей отдела Planctomycetes позволяет пролить свет на происхождение метаногенеза и метилотрофии^[12]. Уникальной особенностью геномов представителей отдела Planctomycetes является отсутствие оперонной структуры генов некоторых важных метаболических путей^[10], что также не характерно для прокариот. Сравнение нуклеотидных последовательностей некоторых генов показывает больший уровень гомологии с таковыми у эукариот — например ген Gemmata obscuriglobus проявляет большой уровень гомологии с геном, кодирующим белок интегрин-альфа-V, играющим большую роль в трансмембранной сигнальной трансдукции у эукариот^[13].

Жизненный цикл

Имеется чередование между неподвижными сидячими формами и формами, подвижными за счет наличия жгутиков. Сидячие клетки при почковании образуют подвижные клетки с жгутиками, которые затем прикрепляются к субстрату и сами становятся сидячими, продуцируя при помощи почкования новые подвижные клетки.

См. также

• Систематика прокариот
• Анаэробное окисление аммония

Примечания

1. ↑ The ISME Journal — Fosmids of novel marine Planctomycetes from the Namibian and Oregon coast upwelling systems and their cross-comparison with planctomycete genomes
2. ↑ Monitoring a widespread bacterial group: in situ detection of planctomycetes with 16S rRNA-targeted probes — Neef et al. 144 (12): 3257 — Microbiology
3. ↑ Diversity of Planctomycetes in Soil in Relation to Soil History and Environmental Heterogeneity — Buckley et al. 72 (7): 4522 — Applied and Environmental Microbiology
4. ↑ Detection of representatives of the Planctomycetes in Sphagnum peat bogs by molecular and cultivation approaches
5. ↑ Phylogenetic and Metabolic Diversity of Planctomycetes from Anaerobic, Sulfide- and Sulfur-Rich Zodletone Spring, Oklahoma — Elshahed et al. 73 (15): 4707 — Applied and Enviro …
6. ↑ http://www.wfcc.info/NEWSLETTER/newsletter38/a1.pdf
7. ↑ ScienceDirect — Organic Geochemistry : The occurrence of hopanoids in planctomycetes: implications for the sedimentary biomarker record
8. ↑ Cell compartmentalisation in planctomycetes: novel types of structural organisation for the bacterial cell
9. ↑ INTRACELLULAR COMPARTMENTATION IN PLANCTOMYCETES — Annual Review of Microbiology, 59(1):299 — Abstract
10. ↑ ^{1 2} Complete genome sequence of the marine planctomycete Pirellula sp. strain 1 — PNAS
11. ↑ The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae an… [Curr Opin Biotechnol. 2006] — PubMed result
12. ↑ The Enigmatic Planctomycetes May Hold a Key to the Origins of Methanogenesis and Methylotrophy — Chistoserdova et al. 21 (7): 1234 — Molecular Biology and Evolution
13. ↑ Cheryl Jenkins, Vishram Kedar, and John A. Fuerst (2002). Gene discovery within the planctomycete division of the domain Bacteria. Genome Biology 3 (6): research0031.1-0031.11.

Ссылки

Научные ссылки

• Ссылки на PubMed для Planctomycetes
• Ссылки на PubMed Central для Planctomycetes
• Ссылки на Google Scholar для Planctomycetes

Научные базы данных

• Искать таксономию в NCBI для Planctomycetes
• Искать в Tree of Life таксономию для Planctomycetes
• Искать в Species2000 страницы о Planctomycetes
• Страница в MicrobeWiki о Planctomycetes